（一）網(wǎng)絡(luò)安全問題

對于企業(yè)來說，數(shù)據(jù)的安全性至關(guān)重要，尤其是財務(wù)數(shù)據(jù)和客戶信息，這些數(shù)據(jù)是一個企業(yè)的核心機(jī)密。基于網(wǎng)絡(luò)的SaaS模式在網(wǎng)絡(luò)遭遇黑客攻擊、病毒侵害等網(wǎng)絡(luò)安全問題時，系統(tǒng)癱瘓、數(shù)據(jù)丟失等都是無法避免的，即使有數(shù)據(jù)備份或者丟失的財務(wù)數(shù)據(jù)可以恢復(fù)。丟失的財務(wù)數(shù)據(jù)給企業(yè)帶來的損失也將會非常嚴(yán)重。
 
（二）對SAAS提供商的信任度問題
 
基于SaaS的在線管理服務(wù)層出不窮，如在線會計，在線進(jìn)、銷、存，在線客戶關(guān)系管理，在線“儲錢罐”等。企業(yè)在使用一種在線管理服務(wù)后，若發(fā)現(xiàn)有更適合該企業(yè)的在線管理服務(wù)，要轉(zhuǎn)向另一家SaaS提供商提供的在線管理服務(wù)，企業(yè)財務(wù)數(shù)據(jù)的安全性就會受到影響，因為企業(yè)的財務(wù)數(shù)據(jù)存放在前面一家SaaS提供商的服務(wù)器上。
 
（三）服務(wù)器運算能力問題
 
SaaS模式下，企業(yè)只需每年繳納一定的租賃使用費就可滿足自身信息化的需求，而且使用的人越多，均攤的成本越低。而SaaS模式主要是面向中小企業(yè)，而我聞中小企業(yè)數(shù)目眾多，且期初期未是各個企業(yè)財務(wù)處理的高峰時期，因此，在期初期末中小企業(yè)用戶數(shù)增多時，SaaS提供商服務(wù)器的運算能力會出現(xiàn)瓶頸，網(wǎng)絡(luò)的運行速度也會受影響，從而影響企業(yè)財務(wù)處理的時效性。
 
（四）與企業(yè)原各子系統(tǒng)的集成問題
 
企業(yè)信息化系統(tǒng)涉及生產(chǎn)、銷售、客戶關(guān)系管理、人力資源等許多方面的管理。這些管理子系統(tǒng)往往是根據(jù)企業(yè)的實際情況開發(fā)實施的，基于SaaS模式的財務(wù)管理信息系統(tǒng)能否與市場現(xiàn)有技術(shù)、企業(yè)現(xiàn)有子系統(tǒng)和數(shù)據(jù)庫之間實現(xiàn)無縫集成是個問題。