愛沙尼亞公司注冊的類型主要有：

1、代表處：由外國母公司或其授權代表向愛沙尼亞商業注冊局提交所需文件申請登記成立代表處。文件中應包括母公司資質證明、代表授權書、公司章程、財務報告等情況。

2、分公司：由外國母公司或其委托人向愛沙尼亞商業注冊局申請登記注冊設立分公司。文件中需由母公司提交相應的證明文件，包括公司性質、資金規模等。對分公司注冊的資金沒有具體規定。

3、有限責任公司(au)：有限責任公司可以由一人或多人合作成立，持股人可將股份轉讓給其它持股人，在轉股給第三方時，其它持股人擁有優先購買權。公司的法人代表對公司的財務有管理權。自2011年起，規定該類企業的最低注冊資本金不能少于2500歐元，資金帳戶需開設到指定銀行。

4、股份有限公司(AS)：股份有限公司可由一個或多個需認購股份的自然人或法人成立。股份可以自由轉讓給第三方，但不可分割。股份有限公司的管理通過持股人、董事會和監事會的全體大會運作。自2011年起，規定注冊股份有限公司最低股本金不能少于25000歐元。